דני מלקונוביצקי הצטרף כעמית למכון ב-2023. הוא סיים בהצטיינות תואר שני בחקר השואה באוניברסיטת חיפה ואת עבודת התזה שלו כתב על תעמולה אנטישמית חזותית במערב אוקראינה תחת הכיבוש הנאצי בהנחיית פרופסור פר אנדרס רודלינג מאוניברסיטת לונד. ב-2019 הישגיו האקדמיים זיכו אותו בפרס ומלגה מטעם קרן זרחי למורשת יהדות פולין וכן במלגת הצטיינות מטעם המועצה הישראלית להשכלה גבוהה. ביוני 2021 השתתף בכנס מטעם מכון ויזנטל שבאוניברסיטת וינה והרצה על האסתטיקה האנטי-פאשיסטית ביצירות הקולנוע והטלוויזיה של הבמאי גיירמו דל טורו. בין 2020 ל-2022 עבד כחוקר במחלקת יעץ ומידע של אגף הארכיונים ביד ושם. את עבודת הדוקטורט שלו הוא כותב בהנחיית פרופסור עמוס גולדברג ממכון יהדות זמננו ודוקטור קובי קבלק מ-Pennsylvania State University. נושא מחקרו הוא שפת האנטישמיות הנאצית בה הוא מתמקד בעקבות להשפעת רטוריקה מילולית וחזותית ברייך השלישי ולאחריו.